El proyecto nace en 2008, cuando la Universidad de Navarra recibe la donación de la colección de arte contemporáneo de María Josefa Huarte Beaumont. El Museo albergará no solo esta colección de arte sino también el Fondo Fotográfico, que la Universidad tiene desde 1990 (legado de José Ortiz-Echagüe), que se ha ido ampliando a lo largo de los años con nuevas donaciones y adquisiciones. La colección de fotografía de la Universidad de Navarra es una de las colecciones más amplias y de mayor interés de nuestro país, con más de 10.000 fotografías y 100.000 negativos.
El Museo constará de 11.000 metros cuadrados, de los cuales 2.700 serán salas expositivas. El otro gran espacio del recinto lo conforma el Auditorio, con capacidad para 700 espectadores y buen nivel de equipamiento escénico. La realización del Museo, de 11.000 metros cuadrados, supondrá una inversión total de 25 M€.
No es la primera vez que Moneo trabaja en Navarra. Los proyectos del Archivo Real, la reforma de la plaza de toros, la plaza de los Fueros, son algunos de sus proyectos previos.Para explicar el origen del proyecto Moneo comento su conocida vinculación con toda la familia Huarte, que viene de lejos. "Conocí muy de cerca a Félix Huarte, muy importante en la historia de la construcción en España desde los años de la República. Le gustaba hacer gala de la calidad de su hormigón. Sus cuatro hijos (Jesús, Juan, María Josefa y Felipe) siguieron con los negocios a la vez que hacían sus propias colecciones de arte. Pero puede que la colección de ella, de María Josefa, sea la más especial".
